בתחומים שונים של מחקר ויישום מיקרו-אצות, הטכנולוגיה של שימור לטווח ארוך של תאי מיקרו-אצות היא קריטית. שיטות מסורתיות לשימור מיקרו אצות עומדות בפני אתגרים מרובים, כולל ירידה ביציבות הגנטית, עלויות מוגברות וסיכוני זיהום מוגברים. כדי לתת מענה לבעיות אלו, פרוטוגה פיתחה טכניקת שימור בהקפאה בזכוכית המתאימה למיקרו אצות שונות. הניסוח של תמיסת ההקפאה חיונית לשמירה על החיוניות והיציבות הגנטית של תאי מיקרו-אצות.

נכון לעכשיו, למרות שבוצעו יישומים מוצלחים על Chlamydomonas reinhardtii, ההבדלים המבניים הפיזיולוגיים והתאיים בין מיני מיקרו-אצות שונים פירושם שכל מיקרו-אצה עשויה לדרוש ניסוחים ספציפיים להגנה מפני קריו. בהשוואה לתמיסות ההקפאה המשמשות בטכניקות אחרות להקפאה של תאים מיקרוביאליים ובעלי חיים, תמיסת שימור ההקפאה עבור מיקרו-אצות צריכה להתחשב במבנה דופן התא, עמידות לכפור ותגובות רעילות ספציפיות של מגנים לתאי מיקרו-אצות ממינים שונים של אצות.

טכנולוגיית שימור ההקפאה של מיקרו-אצות משתמשת בפתרונות שימור הקפאה שתוכננו במיוחד כדי לאחסן תאים בטמפרטורות נמוכות במיוחד, כגון חנקן נוזלי או -80 מעלות צלזיוס, לאחר תהליך קירור מתוכנת. גבישי קרח נוצרים בדרך כלל בתוך התאים במהלך הקירור, וגורמים לנזק למבנה התא ואובדן תפקוד התא, מה שמוביל למוות של תאים. על מנת לפתח פתרונות להקפאה של מיקרו-אצות, פרוטוגה ערכה מחקר מעמיק על המאפיינים התאיים של מיקרו-אצות, כולל תגובותיהן למגנים שונים וכיצד להפחית בצורה היעילה ביותר נזקים הנגרמים מקפיא ולחץ אוסמוטי. זה כולל התאמות מתמשכות לסוג, ריכוז, רצף ההוספה, תהליכי קירור מקדים והחלמה של חומרי הגנה בתמיסת ההקפאה, וכתוצאה מכך לפיתוח תמיסת שימור מיקרו-אצות רחבת טווח בשם Froznthrive ™ וטכנולוגיית הקפאת הזגוג התומכת.